El Núcleo Académico del Programa Doctoral está constituido por 9 profesores de tiempo completo y tres profesores asignados a través del Programa Cátedras CONAHCYT; son integrantes de cinco Cuerpos Académicos y un Grupo de Investigación registrados ante PRODEP y la Institución, respectivamente. El 75% de los profesores pertenece al Sistema Nacional de Investigadores e Investigadoras (SNII) en los niveles I y II; los profesores de tiempo completo con adscripción a la UNACH, son integrantes del Sistema Estatal de Investigadores (SEI) y cuentan con el reconocimiento de Perfil Deseable PRODEP. En la formación de los estudiantes del doctorado colaboran también académicos de tiempo parcial de la UNACH así como de otras instituciones de educación o investigación, nacionales y extranjeras.

Manejo sustentable de recursos naturales
	Dr. René Pinto Ruiz SNII, Nivel 1		Dr. Juan Francisco Aguirre Medina SNII, Nivel 1
	Dr. Deb Raj Aryal SNII; Nivel 1		Dr. Juan Manuel Villarreal Fuentes SNII, Nivel 1
	Dr. Leopoldo Medina Sanson SNII, Nivel 2		Dr. Hernán Orbelín Mandujano Camacho SNII, Nivel C
Tecnología e innovación para el desarrollo rural sustentable
	Dr. Francisco Guevara Hernández SNII, Nivel 2		Dra. María Guadalupe Rodríguez Galván SNII, Nivel C
	Dr. Pedro Cadena Iñiguez		Dra. María de Lourdes Zaragoza Martínez SNII, Nivel C
Recursos genéticos y biotecnología para la sustentabilidad agropecuaria
	Dr. José Apolonio Venegas Venegas SNII, Nivel 1		Dr. Gerardo Uriel Bautista Trujillo SNII, Nivel 1
	Dra. Mariela Beatriz Reyes Sosa SNII, Nivel 1